承蓝助力中科院昆明动物所建设小动物磁共振数据处理平台
研究脑疾病及高级脑认知功能必须使用更接近人类的灵长类动物。针对小动物磁共振的影像分析需要根据物种、样本、研究方法做调校与检验,再使用不同的配准算法、组织分割模版、标准解剖学参照模版、数据分析算法做进一步处理。
承蓝为小动物脑影像研究提供了从数据采集、管理到处理的全流程解决方案,为用户测试、适配了恒河猴、食蟹猴、小鼠、大鼠等多种动物脑模板及影像数据分析工具;建立多模态数据库,实现跨物种、跨模态的数据查询、检索、关联功能;通过计算集群大幅度提高了影像数据的处理速度及处理能力,为多模态神经影像数据管理及高性能计算提供了成熟范本。
图示1:基于白质、灰质分割模板的皮质表面及3D打印
图示2:食蟹猴脑图谱模板构建流程
用户案例:通过承蓝提供的解决方案,使用162只2-9岁健康食蟹猴的磁共振结构影像建立大样本猕猴脑影像标准化模型。
相关研究链接:Qiming Lv, Normative Analysis of Individual Brain Differences Based on a Population MRI-Based Atlas of Cynomolgus Macaques, Cerebral Cortex, Volume 31, Issue 1, January 2021, Pages 341–355.